Микробиом кишечника может предсказать ответ на биологическую терапию воспалительного заболевания кишечника

«В настоящее время мы ограничены в нашей способности предсказать, какие пациенты будут реагировать на то или иное лечение», — говорит Эшвин Анантакришнан, MBBS, отделения гастроэнтерологии MGH, ведущий автор статьи. «Наше открытие, что состав и функция кишечных бактерий перед лечением могут предсказать реакцию на лечение, предлагает новый дополнительный инструмент для персонализированного выбора терапии».Воспалительные заболевания кишечника, такие как болезнь Крона и язвенный колит, являются аутоиммунными заболеваниями, при которых иммунная система задействует собственные ткани организма, в данном случае желудочно-кишечный тракт. Традиционные методы лечения включают противовоспалительные и иммунодепрессивные препараты, но биологические препараты, представленные в последние годы, более точно нацелены на определенные аспекты иммунного ответа и имеют лучшие результаты у многих, но не у всех пациентов с ВЗК или другими аутоиммунными состояниями.Предыдущие попытки определить, какие пациенты могут реагировать на определенные биологические препараты на основе их симптомов и экспрессии генов в пораженных тканях, имели лишь умеренный успех.

Поскольку недавние обширные исследования показали, что микробиом кишечника играет важную роль в нескольких расстройствах иммунной системы, группа исследователей изучила, может ли он также определять реакцию на биологическое лечение ВЗК.В исследование было включено 85 пациентов — 43 с язвенным колитом и 42 с болезнью Крона, которые начали лечение ведолизумабом (Entyvio), биологическим препаратом на основе моноклональных антител, который предотвращает миграцию лейкоцитов в воспалительную ткань кишечника. Образцы стула, взятые перед лечением ведолизумабом и через 14, 30 и 54 недели лечения, анализировали как на состав микробной популяции, так и на функциональные качества на основе паттернов экспрессии микробных генов.Было обнаружено, что участники, которые соответствовали критериям ремиссии симптомов ВЗК через 14 недель, имели более разнообразную микробную популяцию до лечения — с большим количеством потенциально противовоспалительных видов — чем участники, не достигшие ремиссии.

Еще более поразительными были различия в микробных функциональных моделях между теми, кто достиг и не достиг ремиссии — как до лечения, так и через 14 недель после начала лечения. Для тех, кто находился в ремиссии через 14 недель, микробные изменения, наблюдаемые в этот момент, сохранялись не менее года, что указывало на то, что ранние изменения могут определять пациентов, которые могут достичь и поддерживать ответ на лечение.В то время как Анантакришнан, доцент медицины Гарвардской медицинской школы (HMS), отмечает, что текущие затраты на секвенирование микробиома делают его использование для рутинного скрининга непрактичным, технологические усовершенствования как бы сокращают эти затраты. «Возможность выбрать лечение, которое, скорее всего, подействует на пациента, будет чрезвычайно полезна как для быстрого достижения ремиссии, так и для предотвращения воздействия лекарств, которые вряд ли подействуют, могут быть дорогостоящими и могут иметь побочные эффекты», — говорит он. . «В дополнение к тестированию этого подхода на больших группах пациентов и с различными лекарствами, чтобы увидеть, может ли он выявить сравнительную эффективность, мы надеемся использовать эти данные для разработки целевых пробиотиков, которые могут помочь скорректировать популяцию у пациентов с неблагоприятным исходным микробиомом. . "