Профессор Хюн-Гю Пак из Департамента химической и биомолекулярной инженерии Корейского передового института науки и технологий (KAIST) разработал методику анализа различных целевых ДНК с использованием аптамера, фрагмента ДНК, который может распознавать и связываться с конкретным белком или фермент. Этот метод позволит разработать доступную генетическую диагностику новых бактерий или вирусов, таких как респираторный синдром средней легкости (MERS). Результаты исследования были опубликованы в июньском выпуске Chemical Communications, выпущенном Королевским химическим обществом Великобритании.
Статья была выбрана ведущей статьей журнала.Существующий метод генетической диагностики, основанный на молекулярных радиомаяках, требует нового радиомаяка всякий раз, когда целевая ДНК мутирует.
Следовательно, анализ различных целевых фрагментов ДНК был дорогостоящим. Чтобы решить эту проблему, команда профессора Парка разработала аптамер, который связывает и дезактивирует ДНК-полимеразу.
Метод был использован в обратном порядке, так что аптемер не связывается с полимеразой, сохраняя свое активированное состояние, только если присутствует целевая ДНК.Контролируемая активация и дезактивация ДНК-полимеразы позволяет нуклеиновой кислоте удлиняться или сокращаться, что позволяет измерять сигналы флуоресценции, исходящие от зондов TaqMan. Этот же зонд можно использовать для обнаружения различных ДНК-мишеней, что приведет к разработке нового и чувствительного метода генетической диагностики.В отличие от существующей техники зонда с молекулярным маяком, требующей нового зонда для каждой целевой ДНК, в этом новом методе используется тот же флуоресцентный зонд TaqMan, который дешевле и проще для обнаружения ряда различных фрагментов целевой нуклеиновой кислоты.
Применение этого метода сделает процесс идентификации и обнаружения чужеродных ДНК патогенов, таких как вирусы и бактерии, более доступным и простым.Профессор Пак сказал: «Этот метод позволит нам разработать более простые диагностические наборы для новых патогенов, таких как MERS, что позволит быстрее реагировать на различные заболевания.
Наша технология также может широко применяться в области генетической диагностики».