Секвенирование типа генетического материала в раковых опухолях, называемого информационной РНК, изменило индивидуальную терапию рака и позволило выявить биомаркеры для раннего обнаружения. Достижения в этой области изменили представление ученых о различиях между здоровыми тканями и опухолями.На сегодняшний день экспрессия генов в опухолях обычно определяется путем захвата матричных РНК; однако они представляют только часть обнаруженных молекул. Другой тип РНК, называемый некодирующей РНК, долгое время считался «мусором» и не учитывался в процессах секвенирования.
Однако недавние достижения в области генетики показали, что многие некодирующие РНК могут нести важные функции для клеточной биологии, а класс РНК, известный как повторяющиеся элементы, может взаимодействовать с иммунной системой таким образом, который может иметь важное значение для развития нового и персонализированного рака. иммунотерапия.В своем исследовании исследователи использовали процесс, называемый секвенированием общей РНК, чтобы идентифицировать многие некодирующие РНК, которые обычно остаются незамеченными при использовании более распространенного метода секвенирования. Они показали, что некоторые из этих РНК специфически экспрессировались в опухолях, которые реагировали на иммунотерапию блокадой контрольных точек у пациентов с раком мочевого пузыря, в то время как другие были связаны с опухолями, которые не были обнаружены иммунной системой.
«Наши выводы свидетельствуют о том, что некодирующая РНК в опухолях, особенно повторяющихся элементах, недооценивается», — сказал старший автор исследования Бенджамин Гринбаум, доктор философии, доцент кафедры онкологии, патологии и медицины (гематология и медицинская онкология). ) в Институте рака Тиш при Медицинской школе Икана на горе Синай. «Мы считаем, что важные выводы станут результатом анализа всей широты взаимодействия некодирующей РНК опухоли с иммунной системой».Одно конкретное открытие этого исследования заключалось в том, что один повторяющийся элемент в некодирующей РНК является лучшим предиктором иммунотерапевтического ответа на ингибиторы PDL1, тип лекарственного средства для иммунотерапии рака, чем обычные иммунные сигнатуры у некоторых пациентов.
Исследователи Mount Sinai в сотрудничестве с лабораторией Ting в онкологическом центре Массачусетской больницы общего профиля обнаружили, что эти повторяющиеся РНК, по-видимому, изменяют иммунный ответ при раке толстой кишки и поджелудочной железы. Это имеет значение для будущих исследований того, как некодирующие РНК могут быть новыми мишенями для лечения рака и как они влияют на реакцию пациентов на лечение рака.