Известно, что ДНК-вирусы используют миРНК инфицированных ими клеток; они даже производят свои собственные. В прошлом году ученые Рокфеллера были удивлены, обнаружив, что вирус гепатита С, содержащий РНК, а не ДНК, не только секвестрирует миРНК хозяина, но и полагается на нее. Теперь та же команда, в которую входят исследователи из лабораторий Чарльза М. Райса, профессора Мориса Р. и Корин П. Гринбергов и главы лаборатории вирусологии и инфекционных заболеваний, а также Роберта Б. Дарнелла, профессора Роберта и Харриет Хейлбрунн. и руководитель лаборатории молекулярной нейроонкологии — обнаружил доказательства того, что другой РНК-вирус, вирус вирусной диареи крупного рогатого скота, который поражает коров и другой домашний скот, также зависит от микроРНК для инфекции. Их результаты представлены в Cell Host and Microbe.
Новая геодезическая техникаЧтобы увидеть, используют ли другие РНК-вирусы, кроме ВГС, миРНК хозяина, исследователи разработали метод скрининга, который химически прикрепляет эти миРНК к их мишеням. «Проблема биоинформатического поиска мишеней miRNA в том, что они достаточно малы, чтобы встречаться через каждые несколько тысяч оснований в транскриптоме», — говорит Троелс Шил, первый автор исследования, ныне работающий в Копенгагенском университете. «Более того, вычислительные подходы обычно не знают, что экспрессируется в разных типах клеток», и, следовательно, последовательности мРНК, которые они идентифицируют как мишени миРНК, могут иметь физиологическое значение.Напротив, биохимическое сканирование, разработанное в лабораториях Дарнелла и Райса, названное CLEAR-CLIP, идентифицирует реальные последовательности-мишени miRNA путем физического связывания miRNA с некоторыми из ее целевых мРНК без необходимости в какой-либо априорной информации о последовательности.«Является ли HCV особенным?
Его зависимость от miRNA уникальна?» — подумал Джозеф Луна, постдок из лаборатории Райса. Чтобы выяснить это, он и его коллеги использовали CLEAR-CLIP для анализа взаимодействия пятнадцати РНК-вирусов с миРНК хозяина.
Среди них было несколько вирусов, вызывающих заболевания человека, в том числе полиовирус, лихорадка денге и вирус чикунгунья. Их анализ показал, что вирус вирусной диареи крупного рогатого скота, или BVDV, пестивирус, вызывающий серьезные проблемы в мясной и молочной промышленности, специфически связан как с miR-17, так и с другой микроРНК хозяина, называемой let-7.BVDV полагается на miR-17, а также губит егоОбычно миРНК действуют путем подавления экспрессии генов или их трансляции в белок.
Но в этом случае miR-17 стабилизирует геном BVDV так же, как miR-122 для HCV. После заражения своего хозяина вирус берет его под контроль, изменяя экспрессию его генов. А поскольку BVDV поглощает так много miR-17 клетки-хозяина, он не позволяет этой miRNA репрессировать гены-хозяева, которые обычно находятся под ее контролем.Ученые обнаружили, что они могут ослабить репликацию и производство вируса, подавляя его взаимодействие с miRNA.
Они говорят, что miR-17 может стать эффективной мишенью для разработки новых препаратов для борьбы с BVDV.В отчете исследователи предполагают, что зависимость от миРНК хозяина может быть общим явлением в репликации пестивирусов, хотя они еще не уверены, какой биологической цели она может служить.
Но независимо от его функции, это взаимодействие между пестивирусами и miRNA может обеспечить зрелую мишень для противовирусной терапии, поскольку от этого зависит репликация вируса.