ST258 K. pneumoniae является преобладающей причиной инфекций человека среди бактерий, классифицируемых как устойчивые к карбапенемам Enterobacteriaceae (CRE), от которых ежегодно умирают около 600 человек в США и заболевают еще тысячи. Большинство CRE-инфекций происходит в больницах и учреждениях длительного ухода среди пациентов, которые уже ослаблены несвязанными заболеваниями или прошли определенные медицинские процедуры. В новом исследовании ученые из Национального института аллергии и инфекционных заболеваний Национального института здравоохранения (NIAID) и их коллеги секвенировали полные геномы штаммов ST258 K. pneumoniae, собранные у двух пациентов в больницах Нью-Джерси. Сравнивая эти эталонные геномы с последовательностями генов из дополнительных 83 клинических изолятов ST258 K. pneumoniae, ученые обнаружили, что штаммы в целом разделились на две отдельные группы, каждая со своей собственной историей эволюции.
Дальнейший анализ показал, что большинство различий между двумя группами происходит в одной «горячей точке» генома, содержащей гены, которые производят части внешней оболочки бактерии. Исследователи планируют продолжить изучение того, как эти генетические различия могут повлиять на способность бактерий уклоняться от иммунной системы человека.Результаты этого исследования подчеркивают богатство информации, которую можно получить при секвенировании генома.
Они также демонстрируют важность секвенирования для наблюдения и точного отслеживания распространения бактерий. В число участников исследования входили финансируемые NIAID ученые из Научно-исследовательского института общественного здравоохранения и Медицинской школы Нью-Джерси и Университета Рутгерса, а также исследователи из Университета Кейс Вестерн Резерв, Хьюстонского методистского научно-исследовательского института и больничной системы и Лаборатории Рокки Маунтин (NIAID), где проводилось сравнительное секвенирование генома. состоялся.