Аутоиммунные заболевания, такие как диабет 1 типа, болезнь Крона и ювенильный идиопатический артрит, в совокупности затрагивают от 7 до 10 процентов населения в Западном полушарии.«Наш подход сделал больше, чем просто обнаружил генетические ассоциации между группой заболеваний», — сказал руководитель исследования Хакон Хаконарсон, доктор медицинских наук, директор Центра прикладной геномики в Детской больнице Филадельфии (CHOP). «Мы определили гены, имеющие биологическое отношение к этим заболеваниям, действующие по генным сетям и путям, которые могут стать очень полезными мишенями для терапии».Газета появилась в сети сегодня в журнале Nature Medicine.Международная исследовательская группа провела метаанализ, в том числе исследование случай-контроль с участием 6035 субъектов с автомиммунными заболеваниями и 10700 контрольных лиц европейского происхождения.
Ведущий аналитик исследования Юн (Роуз) Ли, доктор медицинских наук. аспирант Пенсильванского университета и Центра прикладной геномики под руководством Хаконарсона и его исследовательской группы применил инновационные и интегративные подходы в поддержку изучения патогенной роли генов, выявленных при множественных заболеваниях.Исследование охватывало 10 клинически различных аутоиммунных заболеваний, начавшихся в детстве: диабет 1 типа, целиакия, ювенильный идиопатический артрит, часто встречающийся вариабельный иммунодефицит, системная красная волчанка, болезнь Крона, язвенный колит, псориаз, аутоиммунный тиреоидит и анкилозирующий спондилит.
Поскольку многие из этих заболеваний передаются по наследству, а отдельные пациенты часто страдают более чем одним аутоиммунным заболеванием, клиницисты давно подозревали, что эти состояния имеют общую генетическую предрасположенность. Предыдущие полногеномные ассоциативные исследования выявили сотни генов предрасположенности к аутоиммунным заболеваниям, в основном поражающим взрослых.Настоящее исследование представляет собой систематический анализ одновременно нескольких детских заболеваний. Исследовательская группа обнаружила 27 локусов в масштабе всего генома, в том числе пять новых локусов, среди изученных заболеваний.
Из этих 27 сигналов 22 были общими по крайней мере двумя из аутоиммунных заболеваний, и 19 из них были общими, по крайней мере, тремя из них.Многие из генных сигналов, обнаруженных исследователями, были связаны с биологическими путями, функционально связанными с активацией клеток, их пролиферацией и сигнальными системами, важными для иммунных процессов. Один из пяти новых сигналов рядом с геном CD40LG был особенно убедительным, сказал Хаконарсон, добавив: «Этот ген кодирует лиганд рецептора CD40, который связан с болезнью Крона, язвенным колитом и глютеновой болезнью.
Этот лиганд может представлять еще одна многообещающая лекарственная мишень для лечения этих заболеваний ».По словам Хаконарсона, многие из 27 сигналов генов, обнаруженных исследователями, имеют биологическое отношение к процессам аутоиммунных заболеваний. «Вместо того, чтобы смотреть на общую экспрессию генов во всех клетках, мы сосредоточились на том, как эти гены усиливают экспрессию генов в определенных типах клеток и тканях, и обнаружили закономерности, которые имели прямое отношение к конкретным заболеваниям. Например, среди нескольких заболеваний мы видели гены с более сильной экспрессией в В-клетках. Рассматривая такие заболевания, как волчанка или ювенильный идиопатический артрит, которые характеризуются дисфункцией В-клеток, мы можем начать разработку методов лечения, чтобы снизить чрезмерную экспрессию в этих клетках ».
Он добавил, что «уровень детализации, обнаруженный исследовательской группой, дает возможность исследователям лучше нацеливать генные сети и пути при определенных аутоиммунных заболеваниях, и, возможно, на основе наших результатов точно настроить и ускорить разработку лекарств путем перепрофилирования существующих лекарств».