Северный олень (Rangifer tarandus) — единственный полностью одомашненный вид в семействе оленей, или Cervid. Это также единственный олень, который распространен по всему миру: охватывает северную часть, тундру, субарктику, арктику и горные районы северной Азии, Северной Америки и Европы.
В отличие от всех других цервид, не только самцы оленей вырастают и сбрасывают рога, но и самки. С точки зрения животноводства олениное молоко намного богаче белком и содержит меньше лактозы, чем коровье молоко.
Последний аспект делает доступность этого молока интересной, учитывая высокий процент людей с непереносимостью лактозы в мире. Благодаря такому разнообразию уникальных особенностей, доступность последовательности генома северного оленя может предоставить целую сани новой информации и является долгожданным новым членом элитного клуба домашних животных с эталонными геномами, включая корову, овцу и козу.
Эта работа была выполнена группой китайских исследователей из Китайской академии сельскохозяйственных наук в Чанчуне и Северо-Западного политехнического университета в Сиане. Исследователи взяли образец крови у двухлетней самки северного оленя из домашнего стада, содержащегося кочевыми охотниками-пастухами-эвенками в горах Большого Хингана в Китае. Они секвенировали, собрали, аннотировали геном и показали, что он высокого качества. Сравнение генома северного оленя с геномами родственных видов и человека показало, что размер генома северного оленя (2,6 ГБ или 2,6 миллиарда пар оснований) немного меньше, чем у людей, коров и коз, и примерно такого же размера, как у овец. .Первый автор статьи, Чжэпин Ли, доцент Института специальных наук о животных и растениях Китайской академии сельскохозяйственных наук, отметил, что анализ также выявил «335 генов, специфичных для северного оленя, которые могут помочь в понимании особых биологических характеристик. оленей.
Они также могут быть очень полезны для понимания эволюции северных оленей, а также всей семьи Cervid в будущих сравнительных исследованиях геномики северных оленей и других жвачных животных ».С этой целью исследователи также построили эволюционное древо, используя новый геном и уже имеющиеся геномы членов семейства крупного рогатого скота.
Они обнаружили, что северные олени, крупный рогатый скот и козы отделились от общего предка примерно 29,6 миллиона лет назад. Это было в эпоху олигоцена, когда одним из главных изменений стала глобальная экспансия пастбищ.
Эта статья стала одним из победителей первого конкурса GigaScience и призового трека, который используется для продвижения новых передовых исследований. Авторы представили свою работу на специальной сессии на 12-й ежегодной международной конференции BGI по геномике в Шэньчжэне в пятницу, 27 октября.
В рамках открытого научного конкурса эта и другие статьи победителей были рецензированы полностью открыто, чтобы публика могла следить за всем процессом публикации, начиная с открытого доступа к черновику статьи на предпечатном сервере Biorxiv и заканчивая процессом рецензирования. жить с рецензиями, сделанными до принятия решения о публикации в системе оверлейного рецензирования Academic Karma, за которыми следуют редакционные решения, исправления рукописей и публикация статьи со всей перепиской редактора, автора и рецензента, доступной вместе с опубликованной статьей.