Новый аналитический инструмент для флуоресцентного обнаружения двухцепочечной РНК

Исследовательская группа под руководством профессора Сеичи Нисидзава из Высшей школы науки Университета Тохоку сообщила о новом РНК-зонде, который связывается с двухцепочечной РНК (дцРНК) специфическим для последовательности образом.К пептидной нуклеиновой кислоте (PNA) добавляют флуоресцентный краситель тиазоловый оранжевый (TO). Зонд демонстрирует замечательный световой ответ при связывании с дцРНК путем образования триплекса.Зонд имеет слабый ответ на последовательности дцРНК, содержащие ошибочные спаривания, что позволяет селективно определять последовательность флуоресценции дцРНК при разрешении одной пары оснований.

Он также показывает предпочтение связывания с дцРНК перед дцДНК, что является важным селективным процессом для будущих применений в клеточной среде, где сосуществуют РНК и ДНК.В отличие от обычного аналитического метода, который ограничивается одноцепочечными областями РНК, новый аналитический метод позволяет впервые флуоресцентное зондирование структуры и последовательности дцРНК-мишени.

Ожидается, что зонд откроет новые возможности для анализа функций дцРНК-содержащих структур, которые тесно связаны с различными биологическими явлениями и заболеваниями.