Атлас человеческого белка, крупный многонациональный исследовательский проект, поддерживаемый Фондом Кнута и Алисы Валленберг, недавно запустил (6 ноября 2014 г.) интерактивную карту человеческого белка на основе тканей с открытым исходным кодом. База данных, основанная на 13 миллионах аннотированных изображений, отображает распределение белков во всех основных тканях и органах человеческого тела, показывая как белки, ограниченные определенными тканями, такими как мозг, сердце или печень, так и те, которые присутствуют во всех тканях. Ожидается, что как ресурс с открытым доступом он поможет стимулировать разработку новых диагностических средств и лекарств, а также предоставит базовые сведения о нормальной биологии человека.
В статье Science "Тканевый атлас протеома человека" около 20 000 генов, кодирующих белок у людей, были проанализированы и классифицированы с использованием комбинации геномики, транскриптомики, протеомики и профилирования на основе антител, говорит ведущий автор статьи. , Матиас Улен, профессор микробиологии Королевского технологического института Стокгольма KTH и директор программы Human Protein Atlas.
Анализ показывает, что почти половина генов, кодирующих белок, экспрессируется повсеместно и, таким образом, обнаруживается во всех проанализированных тканях.
Примерно 15% генов демонстрируют повышенную экспрессию в одной или нескольких тканях или органах, включая хорошо известные тканеспецифические белки, такие как инсулин и тропонин. Яички или яички содержат больше всего белков, обогащенных тканями, за ними следуют мозг и печень.
Анализ показывает, что около 3000 белков секретируются из клеток, а еще 5500 белков находятся в мембранных системах клеток.
«Это важная информация для фармацевтической промышленности. Мы показываем, что 70% текущих целей для одобренных фармацевтических препаратов являются либо секретируемыми, либо мембраносвязанными белками », — говорит Улен. «Интересно, что 30% этих белковых мишеней обнаруживаются во всех проанализированных тканях и органах.
Это может помочь объяснить некоторые побочные эффекты лекарств и, таким образом, может иметь последствия для будущих разработок лекарств."
Анализ также содержит исследование метаболических реакций, происходящих в разных частях тела человека.
Самый специализированный орган — это печень, в которой происходит большое количество химических реакций, не встречающихся в других частях человеческого тела.