Новый анализ редких аргентинских крыс раскрывает происхождение крупнейшего генома млекопитающих

Исследователи из Университета Макмастера намеревались изучить этот конкретный вид, потому что его геном или полный набор ДНК является самым большим из всех млекопитающих и, похоже, очень быстро увеличивался в размерах.Геном крысы примерно в два с половиной раза больше генома человека, включая 102 хромосомы против 46 у человека, и примерно в два раза больше, чем у одного из ее ближайших родственников, горной крысы вискача.

Самый недавний общий предок этих видов существовал всего около пяти миллионов лет назад.«Эта геномная трансформация поразительна, потому что с эволюционной точки зрения она произошла за очень короткий период времени», — говорит Бен Эванс, биолог из McMaster и ведущий автор нового исследования, опубликованного в журнале Genome Biology and Evolution.Механизм этого роста вызвал много споров среди ученых, некоторые из которых предполагают, что быстрое расширение связано с дупликацией всего генома, когда весь его набор ДНК удваивается.По словам исследователей, дупликация всего генома относительно распространена в некоторых группах, таких как растения — она ??произошла у предков кукурузы, табака, картофеля и многих других цветковых растений.

Другие утверждают, что быстрое расширение генома крысы происходит из-за повторяющейся ДНК — кусочков ДНК, которые многократно повторяются в геноме — в сочетании с делением хромосомы, процессом, при котором одна хромосома делится на две или более в течение эволюционного периода.Чтобы разрешить спор, исследователи сравнили и сопоставили наборы геномных данных красной крысы-вискачи и горной крысы-вискачи.

Их анализ показывает, что геном быстро рос из-за расширения разнообразного набора очень повторяющихся элементов, и они не нашли убедительных доказательств дупликации генома.«Это интересно, потому что те же самые механизмы — расширение повторяющейся ДНК — действуют у людей и вносят вклад в« геномный багаж »или дополнительную ДНК. Это может влиять на болезнь через прерывание функции генов», — говорит Эванс.

Тем не менее, остается много вопросов. Исследователи надеются дополнительно охарактеризовать природу этих повторяющихся элементов.

Например, что они собой представляют и почему расширились? И они все еще расширяются?Исследователи также планируют выяснить, сыграла ли эта генетическая эволюция роль в высокой переносимости крысами высокосолевой диеты.

Этот вид может питаться чрезвычайно солеными растениями, которые растут в его пустынной среде обитания, в то время как горная крыса-вискача не может терпеть такую ??же диету.