Использование больших данных для борьбы с гриппом

Грипп вызывается инфекциями, вызываемыми вирусами гриппа, которые сильно размножаются в дыхательных путях. Чтобы размножаться в клетках дыхательных путей, вирусы полагаются на молекулы хозяина. Таким образом, в последние годы были предприняты попытки идентифицировать и блокировать ключевые молекулы хозяина для этого процесса, чтобы остановить вирус на его пути.

Ингибирование белков хозяина сдерживает рост вирусовЭтот подход также используется в международном исследовании, в котором участвует Цюрихский университет. Исследовательские группы из Швейцарии, Германии и США проанализировали наборы данных из независимых публикаций о молекулах-хозяевах IAV. Эти исследования сосредоточены на совокупности генов («GenOMIC») и белков («ProteOMIC»), необходимых для вируса, и генерируют огромное количество данных.

Благодаря всестороннему анализу этих баз данных «OMIC» были обнаружены 20 ранее неизвестных молекул-хозяев, которые способствуют росту вирусов гриппа А.«Эти неизменяемые белки-хозяева жизненно важны для репликации вирусов», — объясняет профессор Силке Стертц из Института медицинской вирусологии при Цюрихском университете. «Теперь мы можем использовать их, чтобы остановить распространение вируса». Одним из таких белков-хозяев является UBR4, который необходим вирусу для транспортировки вирусных белков к клеточной мембране и создания новых частиц.

Это происходит следующим образом. Вирус гриппа А проникает в хозяйскую клетку.

Затем вирусные компоненты переносятся на поверхность клетки, где образуют новые вирусы. Следовательно, из одной инфицированной клетки-хозяина может развиться до 20 000 новых вирусов гриппа.

Исследование показывает, что блокирование UBR4 подавляет производство новых вирусных частиц в инфицированных клетках. У мышей, например, репликация IAV может быть ослаблена, а развитие болезни замедлится.

Таким образом, исследование предоставляет доказательства того, что блокирование молекул хозяина возможно в качестве терапевтической стратегии для лечения гриппа.Общедоступный веб-портал поддерживает разработку лекарствИсследовательская группа создала упрощенный и удобный веб-портал о гриппе и взаимодействии с хозяином.

Сайт также доступен для других исследователей, позволяет выполнять индивидуальные запросы и предоставляет инструменты анализа для отслеживания белков хозяина, которые, вероятно, участвуют в заражении гриппом. В результате опубликованные данные могут помочь в разработке нового поколения лекарств от гриппа.«Мы ожидаем, что подход, описанный в этом исследовании, и использование« больших данных »позволит преодолеть разрыв между биомедицинскими исследованиями и терапевтическими разработками, а также будет способствовать свежему анализу ранее оставшихся без ответа медицинских вопросов», — говорит соавтор Сумит Чанда из Sanford Burnham Prebys Medical.

Институт открытий (SBP) в Калифорнии.