Периодическая таблица белковых комплексов: исследователи представляют Периодическую таблицу белковых комплексов, что упрощает визуализацию, понимание и прогнозирование того, как белки объединяются, чтобы управлять биологическими процессами.

Почти каждый биологический процесс зависит от взаимодействия белков и их сборки в комплексы особым образом, и многие болезни связаны с проблемами в сложной сборке. Принципы, лежащие в основе этой организации, еще не полностью поняты, но, определяя фундаментальные шаги в эволюции белковых комплексов, новая «периодическая таблица» представляет систематический, упорядоченный взгляд на сборку белков, предоставляя визуальный инструмент для понимания биологической функции.

«Эволюция привела к появлению огромного количества белковых комплексов, и это может показаться немного хаотичным», — объясняет Джо Марш, ранее работавший в кампусе Wellcome Genome, а теперь из отдела генетики человека MRC в Эдинбургском университете. «Но если вы разберете шаги, предпринимаемые белками для превращения в комплексы, то есть несколько основных правил, которые могут объяснить почти все сборки, которые люди наблюдали до сих пор».Различные бальные танцы можно рассматривать как бесконечное сочетание небольшого количества базовых шагов. Точно так же «танец» сборки белкового комплекса можно рассматривать как бесконечные вариации димеризации (один удваивается и становится двумя), циклизации (один образует кольцо из трех или более) и добавления субъединиц (два разных белка связываются друг с другом). . Поскольку это происходит довольно предсказуемым образом, не так сложно, как вы думаете, предсказать, как будет образовываться новый белок.«Мы наводим порядок в беспорядочном мире белковых комплексов», — объясняет Себастьян Анерт из Кавендишской лаборатории Кембриджского университета, физик, который регулярно сталкивается с биологическими проблемами. «Белки могут проходить несколько итераций этих простых шагов, добавляя все новые и новые уровни сложности и приводя к огромному разнообразию структур.

Мы создали классификацию, основанную на этих основных принципах, которая помогает людям разобраться в сложность ".Себастьян добавляет, что исключения из правил интересны сами по себе, так как являются предметом текущих исследований.«Проанализировав десятки тысяч белковых комплексов, трехмерные структуры которых уже были экспериментально определены, мы смогли увидеть повторяющиеся закономерности в происходящих переходах сборки — а с новыми данными масс-спектрометрии мы смогли увидеть более широкую картину, "говорит Джо.

«Основная работа этого исследования находится в области теоретической физики и вычислительной биологии, но его невозможно было бы выполнить без работы наших коллег из Оксфордского университета по масс-спектрометрии», — добавляет Сара Тайхманн, руководитель исследовательской группы Европейского института биоинформатики (EMBL). -EBI) и Wellcome Trust Sanger Institute. «Это еще один отличный пример того, насколько ценными могут быть междисциплинарные исследования».


Оставьте комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *