Новые типы африканской сальмонеллы, связанные со смертельной инфекцией: два новых африканских типа генетически отличаются от западной сальмонеллы Enteritidis

Как сообщается сегодня в Nature Genetics, исследование показало, что африканские типы развивали устойчивость ко многим антибиотикам и вели себя немного иначе, чем те, которые обычно встречаются на Западе. Это говорит о необходимости понять, где в африканской среде обитают бактерии, чтобы предотвратить это заболевание.

Как только сальмонелла попадает в кровоток, это называется инвазивным нетифоидным сальмонеллезом (iNTS), серьезным тропическим заболеванием, которому не уделяется должного внимания. По оценкам, в прошлом году он стал причиной 680 000 смертей в год во всем мире, более половины из которых приходились на Африку.Ученые секвенировали 675 изолятов S. Enteritidis из 45 стран и шести континентов. Анализ геномов сальмонелл выявил три основных типа — общий глобальный и два новых африканских типа.

Обычные микробиологические исследования не позволяют отличить S. Enteritidis, циркулирующие в Африке, от остального мира.Выявление этих новых типов важно, поскольку общий глобальный тип S. Enteritidis обычно ассоциируется с домашней птицей и преимущественно поражает кишечник, вызывая диарею. Однако в Африке два недавно выявленных типа являются основной причиной заражения крови и смерти, потому что у людей со слабой иммунной системой сальмонеллы могут с большей легкостью проходить из кишечника в кровоток. Природный резервуар, из которого эти африканские бактерии передаются людям, неизвестен.

Исследование также показало, что два африканских типа несут больше генов, придающих им устойчивость к обычным антибиотикам. Эти штаммы не реагируют на общедоступные антибиотики, и их необходимо лечить цефалоспоринами или ципрофлоксацином, антибиотиками последней инстанции во многих африканских странах.

Доктор Ник Физи, первый автор из Ливерпульской школы тропической медицины и Института Сэнгера, сказал: «Заболевание iNTS — огромная проблема в Африке, но его трудно идентифицировать из-за отсутствия лабораторных возможностей и трудностей с лечением из-за резистентности к антибиотикам. Используя полногеномное секвенирование бактерий S. Enteritidis в различных условиях, мы выявили три различных типа этих бактерий, которые ранее считались одним типом. У двух новых типов Salmonella Enteritidis мы обнаружили гены устойчивости к антибиотикам, таким как амоксициллин и хлорамфеникол, который до сих пор широко используется в Африке, и распространение устойчивости к антибиотикам последней линии, цефалоспорину, может быть лишь вопросом времени.

Нам срочно необходимо найти стратегии для искоренения этого заболевания ».Профессор Мелита Гордон, ведущий автор из Института инфекций и глобального здравоохранения Ливерпульского университета, сказала: «Чтобы помочь предотвратить это заболевание, срочно необходимы дальнейшие исследования того, где эти африканские типы обитают в окружающей среде и как они передаются или между людьми. Возможно, сальмонелла живет в стоячей воде, поэтому улучшение доступа к санитарии и чистой воде чрезвычайно важно. Вакцина для человека также находится в стадии разработки.

Наши исследования в Малави, в Malawi-Liverpool-Wellcome Trust (MLW) Программа клинических исследований, мы надеемся, даст и осуществит соответствующие стратегии общественного здравоохранения для предотвращения этого заболевания ».Профессор Ник Томсон, ведущий автор из Института Сэнгера, сказал: «Это исследование выдвигает на первый план очень важную проблему: относительно легкая версия бактерии может развиться в более опасный патоген при правильных условиях.

Комбинация ВИЧ и устойчивости к антибиотикам. а отсутствие медицинской помощи и санитарии способствовало тому, что сальмонелла превратилась в смертельную болезнь в Африке, и ее важность изначально не признавалась. Чем больше мы смотрим, тем лучше понимаем, что бактерии, вызывающие легкие заболевания в богатых условиях, могут возникать как причин смертоносных болезней в Африке. Следовательно, первый важный шаг в борьбе с такими болезнями — это способность распознавать различные «типы», что, в свою очередь, позволит нам лучше понять, как бактерии могут использовать различные экологические ниши, в которые мировое человеческое население подвергается опасности ".