Его нет в ваших генах, но он передается по наследству. Это определяет эпигенетическое наследование.
Приставка «эпи» означает «на», а здесь она используется для обозначения «наверху» ДНК. Эпигенетические изменения в вашей ДНК быстро изменяют активацию и дезактивацию генов и могут во многом определять.«Было просто невозможно углубиться и сделать подробные утверждения об эпигенетических вариациях у случайных видов растений без обширных предварительных знаний», — объясняет исследователь NIOO и создатель новой техники epiGBS Томас ван Гурп. Не хватало правильных инструментов.
Совместно с лаборантом Нильсом Вейджемакером из Университета Радбауд в Неймегене и исследователями из Университета Вагенингена был разработан и протестирован метод epiGBS. «Благодаря нашему новому методу это теперь возможно».Дымящийся пистолет)Эпигенетические исследования чрезвычайно выросли как область исследований во всем мире. У людей, например, доказано, что это связано с развитием раковых клеток и факторами окружающей среды, влияющими на плод во время беременности.
К последним относятся такие факторы, как курение или страдания от войн. Интерес к эпигенетике также недавно вошел в область экологических и эволюционных исследований. Участвуют ли быстрые эпигенетические изменения в выживании после эпидемии чумы и изменения климата?Способность адаптироваться жизненно важна с точки зрения экологии и эволюции.
Генетическая адаптация требует времени, но эпигенетические изменения могут произойти быстро. «Это также представляет интерес для производителей сельскохозяйственных культур», — поясняет Ван Гурп. «Можно ли будет улучшить адаптацию следующего поколения растений, обработав родительские растения специальной обработкой?»Как это работает?Как начать? Сначала вы собираете образцы из десятков или даже сотен растений.
Затем вы изолируете ДНК. Теперь вы применяете новый метод, который характеризует только определенные участки ДНК как для генов (генетические), так и для модификаций генов (эпигенетические).
Ван Гурп продолжает уточнять, иллюстрируя нити ДНК руками: «Эта информация может мгновенно раскрыть многие вещи: это тот ген, это этот транспозон, и это эпигенетическая вариация. Это особенно полезный метод для (относительно) неизученных видов, или того, что исследователи называют «без эталонного генома модельного вида». «И теперь все это может произойти в течение двух недель.
Это особенно полезно, потому что у нас есть только несколько модельных видов по сравнению с огромным биоразнообразием на нашей планете.Методы сканирования эпигенетических метильных групп уже существуют. Но эти методы были либо в основном неполными, либо возможными только в том случае, если у вас уже был эталонный геном.
Первый метод оставил вам много догадок, в то время как второй вариант был дорогостоящим и требовал много времени, а это означает, что он никогда не подходил для обычных видов », — объясняет старший научный сотрудник Коен Верховен. «Теперь мы решили обе эти проблемы». Исследователи достигли этого с помощью умного сочетания методов ДНК и мощной биоинформатики, которые помещают фрагменты информации в нужное место. «Начав с нуля, вы создаете генетическую и эпигенетическую карту для нескольких тысяч фрагментов ДНК тех видов, которые вам нужны».Это также немедленно решает еще одну важную проблему: различия в результатах исследований, которые иногда обнаруживаются между модельными видами, такими как арабидопсис, о котором мы знаем все, и другими видами. «Является ли это результатом различий между видами или использованием различных методов?
Это губительно для исследований! ‘ Отныне сравнение, наконец, возможно.Верховен продолжает: «Этот новый метод значительно продвинул область экологической эпигенетики».