Болезнь Крона — воспалительное заболевание пищеварительного тракта, которое вызывает боль в животе, диарею, лихорадку и потерю веса. Хотя считается, что это происходит из-за взаимодействия экологических и генетических факторов, точные причины неясны. Лекарства нет, но люди с этим заболеванием могут избежать обострений, принимая противовоспалительные препараты и изменяя диету.«Диетические методы лечения болезни Крона следует изучать более систематически, и это исследование является хорошим первым шагом», — сказал Деннис Ко, доцент кафедры молекулярной генетики и микробиологии Медицинской школы Дьюка.
Исследование, опубликованное 15 сентября в журнале Genome Biology, основано на новом программном обеспечении для исследователей, которое выявляет связи между, казалось бы, не связанными человеческими заболеваниями и особенностями посредством крошечных общих генетических вариаций, связанных с риском.Исследования показали, что диеты с высоким содержанием жиров могут быть связаны с болезнью Крона, но никогда не объединялись в одну генетику. Некоторые тонкие генетические вариации — такие маленькие, как однобуквенное изменение в ДНК, — кажется, чаще встречаются у людей с болезнью Крона. Отдельные направления работы показывают, что определенные генетические вариации связаны с более высокими уровнями некоторых жирных кислот (молекулярных строительных блоков жира) в кровотоке.
В новом исследовании исследователи определили генетические совпадения между пальмитолеиновой кислотой, типом жирной кислоты омега-7, и болезнью Крона с помощью программного инструмента, который они назвали CPAG («SEE-PAG»; сокращение от Cross-Phenotype Analysis of GWAS). Программное обеспечение позволило им сравнить результаты более 1400 исследований полногеномных ассоциаций (GWAS), опубликованных на данный момент по этой теме.
«Основа подхода состоит в том, чтобы просто спросить:« Является ли [генетическое] совпадение между двумя заболеваниями или чертами больше, чем вы ожидаете, просто случайно? »- сказал Ко, который также является членом Duke Center for Host. -Микробные взаимодействия.В прошлом не было возможности всесторонне ответить на этот вопрос.
По словам Ко, CPAG будет продолжать улучшаться с включением дополнительных данных, и другие исследователи могут использовать программное обеспечение для анализа своих собственных генетических результатов в свете всех опубликованных исследований.Однако программа, как и исследуемые ею полногеномные исследования, не предсказывает взаимосвязь между одним признаком или заболеванием и другим.
Чтобы проверить, является ли уровень жирных кислот в кровотоке причиной или следствием заболевания, исследователи обратились к модели болезни Крона у рыбок данио, разработанной Стефаном Олерсом, научным сотрудником группы Дэвида Тобина в Duke.К удивлению исследователей, не омега-7 (пальмитолеиновая кислота) значительно усугубила воспаление, а ее насыщенный аналог, пальмитиновая кислота, которая содержится в оливковом масле, сливочном масле, сыре, молоке и мясе.
Еще одно неожиданное открытие заключалось в том, что жирная кислота омега-6 (линолевая кислота), содержащаяся в растительных маслах, уменьшала воспаление у рыб. В предыдущем исследовании было показано, что содержание омега-6 в крови людей с болезнью Крона ниже нормы.Ко сразу же отмечает, что эти новые результаты не оправдывают радикальных изменений в питании людей с болезнью Крона: необходимы дополнительные исследования, включая более точный генетический анализ жирных кислот и болезни Крона, а также тестирование на моделях на животных.Соавтор исследования Джон Ролз из Duke и его группа изучают биологические механизмы, лежащие в основе абсорбции липидов — жирных кислот и связанных с ними молекул жира — в кишечнике рыбок данио.
«Если мы сможем углубить наше понимание липидного дисбаланса при болезни Крона и последствий наличия слишком большого или слишком малого количества какого-либо одного липида в частности, то в конечном итоге мы сможем разработать новые стратегии для лечения болезни Крона и других воспалительных заболеваний», — сказал он. — сказал Ролз, доцент кафедры молекулярной генетики и микробиологии Медицинской школы Дьюка.До тех пор Ко и его коллеги будут продолжать исследовать геном человека с помощью своего нового программного обеспечения CPAG и, вероятно, найдут гораздо больше зацепок, сказал Ко.