Несколько лет назад во время лабораторных занятий в университете Ювяскюля новый бактериальный вирус, заражающий хозяина Flavobacterium, был выделен из пробы воды, взятой из озера Ювасъярви, Финляндия. Более подробный анализ, проведенный в сотрудничестве с учеными из университетов Ювяскюля, Хельсинки и Оксфорда, выявил уникальные характеристики этого вируса. Было обнаружено, что вирус, названный FLiP, был первым описанным вирусом с икосаэдрическим капсидом, внутренней липидной мембраной и геномом одноцепочечной ДНК.Без подробного структурного анализа с близким к атомарным разрешением исключительные характеристики FLiP могли бы остаться незамеченными.
В то время как геном вируса показал ограниченную последовательностьПодобно другим известным вирусам, структура главного вирусного капсидного белка была поразительно похожа на структуру, наблюдаемую в двухцепочечных ДНК-вирусах линии PRD1-аденовируса.
FLiP является первым вирусом оцДНК, отнесенным к этой линии. Эти результаты предполагают, что структура капсидного белка может быть использована для дополнения данных о последовательностях при классификации вирусов и при обнаружении их глубоких эволюционных взаимосвязей.Кроме того, открытие FLiP демонстрирует важность подробной характеристики новых вирусов из различных сред для понимания разнообразия микробного мира.
Исследование опубликовано в Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS).