Исследователи заявили, что составление карты аномальных областей дает ученым-онкологам отправную точку для поиска еще не обнаруженных онкогенов и сломанных генов-супрессоров опухолей, которые позволяют клеткам бесконтрольно делиться и расти. Результаты, опубликованные в октябрьском номере журнала Nature Genetics, являются частью продолжающихся международных исследований по определению характера мутаций ДНК и других генетических изменений, которые способствуют развитию рака.По словам авторов, это крупнейший на сегодняшний день анализ роли «изменений числа копий» ДНК в нескольких типах рака.
Нормальные клетки несут две копии 20 000 генов, составляющих геном. Геномы раковых клеток обычно пронизаны областями, в которых генетические последовательности дублируются или удаляются; фактически, изменение числа копий влияет на геном в большей степени, чем любая другая аномалия ДНК при раке.
Целью исследования было выявить закономерности изменения числа копий и определить, как они способствуют развитию рака.При обследовании 4934 видов рака 11 типов, «мы обнаружили, что при раке часто происходит удвоение всего генома, за которым следует большое количество событий изменения меньшего числа копий», — сказал Рамин Бероухим, доктор медицинских наук, доцент медицины в Dana- Фарбер и член-корреспондент Института Броуда. «Мы также увидели склонность изменений числа копий происходить на теломерах [кончиках хромосом], и они демонстрируют особенности, указывающие на то, что они возникают из-за иных механизмов, чем изменения числа копий областей в хромосомах».Берухим является соавтором отчета вместе с Мэтью Мейерсоном, доктором медицины, Дана-Фарбер и Брод, и Гэдом Гетцем, доктором философии, Массачусетской больницы общего профиля и Броуд.Анализ также выявил 70 областей генома рака, которые подвергаются дупликациям — также известным как амплификации — чаще, чем можно было бы ожидать случайно, и 70 областей, которые содержат делеции чаще, чем можно было бы ожидать случайно. «Мы ожидаем, что эти 140 регионов будут содержать ряд пока неизвестных онкогенов и генов-супрессоров опухолей», — сказал Бероухим.
В среднем эти 140 регионов включали от трех до четырех генов. Однако только 35 из областей содержали известные онкогены или гены-супрессоры опухоли, ранее связанные с раком. «Так что в геноме рака еще многое предстоит открыть», — сказал Бероухим. «Эти регионы предоставляют исследовательскому сообществу отправную точку для оценки возможных новых онкогенов и генов-супрессоров опухолей».
Результаты были размещены на общедоступном веб-сайте http://www.broadinstitute.org/tcga.Он добавил, что дальнейшее изучение базы данных вариаций числа копий, созданной исследователями, «поможет нам лучше понять, как возникают раковые заболевания и какие гены задействованы.
И когда мы это поймем, мы сможем разработать диагностические и терапевтические средства, которые противодействуют этим генам».